原位雜交技術可以應用于以下場景:
組織中病毒DNA/RNA的檢測和定位。例如,可以用于檢測EB病毒mRNA、人類狀瘤病毒和巨細胞病毒DNA等。
癌基因、抑癌基因及其他各種功能基因在轉錄水平的表達及其變化的檢測。
檢測染色體的變化,如染色體數量異常和染色體易位等。
在植物基因組研究中的應用。例如,熒光原位雜交,通過與特定基因序列的探針進行雜交,可以在植物染色體上定位到目標基因的位置,進而構建遺傳圖譜,為植物育種和基因組研究提供基礎數據。
將32 P標記的雙鏈DNA探針于100℃加熱5分鐘,迅速置于冰浴中。單鏈探針不必變性。將探針加到雜交袋中雜交過夜。雜交期間,盛濾膜的容器應蓋嚴,以防液體蒸發。
雜交結束后,去除雜交液,立即于室溫把濾膜放入大體積(300-500ml)的2×SSC和0.1% SDS溶液中,輕輕振搖5分鐘,并將濾膜至少翻轉一次。重復洗 一次,同時應避免膜干涸。
68℃用300-500ml 1×SSC和0.1% SDS溶液洗膜兩次,每次1-1.5小時。此時已可進行自顯影。如背景很高或實驗要求嚴格的洗膜條件,可用300-500ml 0.2×SSC和0.1% SDS的溶液于68℃將濾膜浸泡60分鐘。
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